目前，重庆医科大学第一附属医院由原上海第一医学院（现复旦大学）附属医院于1957年在重庆成立。经过60多年的建设和发展，已成为中国首批集医疗、教学、科研、预防、保健、涉外医疗为一体的三级甲等医院和重点大型综合性教学医院之一。医院总部设有36个临床科室，8个医疗技术科室，现有床位3200张。2018年门诊数量340.77一万人，出院病人14.65一万人次，在手术中5.71一万次。患者来自全国各地、美国、澳大利亚、日本等国重庆、四川、贵州等周边省市有24家教学医院和77家指导医院。

   目前，医院总部拥有973名首席科学家、国家杰出青年基金获得者、国务院学位委员会学科评估小组成员、长江学者、卫生部杰出贡献专家、第45届南丁格尔奖章获得者等大量学术成就高、临床经验丰富的知名专家。医院有295名教授、399名副教授、72名博士导师、409名硕士导师，现享受37名政府津贴专家，现任国家协会、协会学术职位667人，重庆学术技术领导和储备候选人47人，重庆医学会副主席58人，重庆医学会副主席45人。

   目前，医院总部形成了以神经科学、肿瘤学、脂糖代谢、眼科和重症医学为代表的五大优势学科群体。医院设有临床医学博士后移动站，博士学位授权点32个，硕士学位授权点36个。目前已建成2个国家重点学科和(内科)-传染病、神经病学)和国家中医药重点学科1个(中西医结合临床)，国家卫生健康委功能性脑病诊治重点实验室。已被批准为国家临床教学培训示范中心。此外，重庆还有34个重点学科，11个重点医学学科，6个重点实验室。医院承担统计源期刊《中国内分泌外科杂志》。此外，近5年(2013-2017年)，承担国家973项目、国家高新技术研发计划(863项目)、国家自然科学基金重点项目、国家重点研发计划等812个纵向科研项目，并获得国家科技进步二等奖38项。2017年，国内论文数量居全国医疗机构第20位。