鄂尔多斯中心医院成立于1950年，是鄂尔多斯唯一的三级综合医院，是内蒙古医科大学临床医学院，成立了内蒙古超声医学研究所，是自治区超声质量控制中心，拥有国家重点临床专业和自治区领先学科超声医学。有16个市领先的重点学科，如影像学、骨科、普通外科和眼科。

   医院是国家卫计委临床药师培训基地和国家住院医师规范化培训基地。建立了消化疾病院士工作站、京蒙合作消化疾病医疗中心、内蒙古自治区第三个胸痛中心。腔镜技术、超声医学、影像医学等专业水平居于自治区先进地位。消毒供应中心是自治区实践基地。建成国家心力衰竭医联体内蒙古自治区中心，神经专业、肿瘤专业、心内专业、呼吸专业成为自治区临床医学研究中心核心成员单位。

   医院设置康巴什部和东胜部，总建筑面积26万平方米，开放床位1856张。年服务的门诊人次、住院人次居自治区前列。拥有PET-CT、宝石CT、3.0T先进的医疗设备，如核磁共振、彩超、血管造影机等。

   医院有博士生12人，博士生导师1人，硕士生导师35人。有国家、自治区主委、副主委23人。享受国务院特殊津贴的专家1人，国家杰出贡献的中青年专家1人，内蒙古草原人才2人，自治区杰出贡献的中青年专家4人，自治区321级人才3人，自治区医疗卫生中青年学术技术带头人2人，鄂尔多斯135人，鄂尔多斯拔尖人才4人，鄂尔多斯草原人才 6人，鄂尔多斯人才 7人，老中医11人，鄂尔多斯科技新星3人，市青年科技新星1人，鄂尔多斯名医7人。

   医院积极开展医疗改革和现代医院管理体系试点，加强医院党建工作，去行政化，全员聘用，同工同酬。rbrvs绩效考核，实现差异化分配，实现全成本核算。建立区域医疗联合体，促进分级诊疗。新的医疗服务项目价格率先在自治区大型医院启用。开展了自治区第一个跨省新农村合作医疗制度的即时报告。